Ipswich PC-1186 - Tarihçe

Ipswich PC-1186 - Tarihçe


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ıpswich

(PC-1186: dp. 295, 1.174'; b. 23'; dr. 8'; s. 19 k.; cpl.
65; a.13'',140mm.,220mm.,2rkt.,4dcp.,2dct.)

PC-1186, Gibbs Gas Engine Co., Jacksonville, Fla., 20 Nisan 1943; 27 Eylül'de başlatıldı; Bayan George Wharton tarafından desteklendi ve 9 Haziran 1944'te görevlendirildi, Lt. (j.g.) Paul L. Adams komuta etti.

Miami, Fla.'da yapılan silkeleme ve ASW eğitiminden sonra, PC-1186 Atlantik'te konvoy eskort görevine atandı. Ağustos'tan Aralık'a kadar New England kıyılarından Guantanamo, Küba'ya kadar eskort, devriye ve keşif görevleri yaptı. Aralık 1944'ün sonlarında, Panama Kanalı ve Küba arasındaki devriye ve eskort operasyonları için Coco Solo, C.Z.'ye geldi.

PC-1186, bu hizmetleri İkinci Dünya Savaşı'nın geri kalanında sürdürdü. Savaştan sonra Kanal Bölgesi'nde devriye gezdi ve 7 Mayıs 1946'ya kadar denizaltılarla eğitim tatbikatları yaptı ve Charleston, SC'ye yelken açtı. PC-1186, 15 Şubat 1956'da Ipswich olarak adlandırıldı. Ipsich ~ 1 Nisan 1959 Donanma Listesinden çıkarıldı ve 16 Eylül 1959'da Hughes Brothers, Inc.'e satıldı.


Ipswich Okulu kısa bir tarihçe

Bu mütevazi kökenlerden okulun erken tarihi, eski öğrencisi Thomas Wolsey'nin iktidara gelmesiyle çok farklı bir seyir izledi. Wolsey, Oxford'daki kolejine öğrenci sağlamak amacıyla okulu yeniden kurmaya başladı. Wolsey'in güvenilir danışmanı Thomas Cromwell bu görevi üstlendi ve okul masraflarını karşılamak için on iki yerel manastırı feshetti.

Bununla birlikte, bir yıldan biraz fazla bir süre sonra Wolsey, Henry VIII için çok ihtiyaç duyulan bir boşanmayı sağlayamadı, gözden düştü ve hükümdar yeni okulunu kapatmaya hevesliydi. Yeni okul binaları için tasarlanan taşlar Ipswich'ten Londra'ya gönderildi ve şimdi Whitehall Sarayı'nın inşasında kullanıldı. Her şeye rağmen Ipswich Okulu hayatta kaldı. Cromwell ikna etti
Henry'nin okula ilk tüzüğünü vermesi, daha sonra Elizabeth I tarafından onaylanması.

On dokuzuncu yüzyılda Ipswich Okulu, Christchurch Park'ın yanındaki şu anki yerine taşındı. Prens Albert 1851'de ana okul binasının temel taşını attı. Bundan kısa bir süre sonra 1883'te Hazırlık Okulu açıldı.
7-11 yaş arası çocuklar için kurulmuş ve Senior School için bir basamak taşı olmuştur. 2006 yılında göz alıcı yeni binasına taşındı.

Ipswich Okulu bir dizi seçkin eski öğrenci talep edebilir: Thomas Wolsey, Kardinal, York Başpiskoposu ve Henry VIII yönetimindeki İngiltere Lord Şansölyesi, neredeyse kesinlikle okula gitti. Ünlü eylem adamları arasında Flodden savaşında İngiliz komutanı Norfolk Dükü Thomas Howard ve Tümamiral Sir Philip Broke yer alıyor. USS Chesapeake ile ünlü bir nişanda HMS Shannon'ın kaptanlığını yaptı. Romancı Henry Rider Haggard, 1870'lerde burada bir öğrenciydi ve Kraliyet Akademisi Başkanı Sir Edward Poynter, Punch'tan Charles Keene ve Edward Ardizzone gibi seçkin sanatçılar okula gitti. Bilim alanında, öncü nöro-fizyolog ve Nobel Ödülü sahibi Sir Charles Sherrington, bugüne kadarki en seçkin Eski Ipswichian'dır.


Ipswichhistory

Kemik Dedektifleri, Tori Herridge ve bir bilim adamları ekibinin, ortaya çıkarılan kemiklerin ardındaki yaşam hikayelerini bir araya getirdiği bir Kanal 4 programıdır.

Son bölümde ekip, 1400 cesedin ağır çalışma, hastalık, cinayet ve muhtemelen ülkenin ilk otopsi belirtilerini gösterdiği Ipswich'teki uzun zamandır unutulmuş bir mezarlığa odaklanıyor.

Yapım ekibi tarafından program için üstlendikleri bazı araştırmalara yardım etmem istendi ve ardından bölümde kısa bir röportajda yer almaya davet edildim.

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

IPSWICH TARİHİ PODCAST BÖLÜM 6

IPSWICH VE HANSETİK LİGİ

Bu bölümde Ipswich Maritime Trust'tan Pat Grimwade ile Ipswich'in Hansa Birliği ile az bilinen bağlantıları hakkındaki yeni yayını hakkında konuşuyorum.

Hansa Birliği, bir zamanlar Geç Ortaçağ Dönemi Avrupa ticaretinin çoğuna egemen olan ve Almanya, Hollanda, İskandinavya, Baltık'ın yanı sıra Ipswich de dahil olmak üzere Britanya'daki birkaç limanları birbirine bağlayan bir tüccar loncaları konfederasyonuydu. Hansa Birliği zirvesinde, Danimarka'ya karşı bir savaş kazanan bir askeri gücü bile bir araya getirdi.

Pat bize, Ipswich'in nasıl bir Hansa limanı haline geldiğini, o dönemde Ipswich'e ne tür şeylerin alınıp satıldığını ve kasabanın günümüzdeki Hansa bağlantılarına dair hangi fiziksel kanıtların kaldığını anlatıyor.

Danzig (günümüz Gdańsk, Polonya) ve Elbing'den (günümüz Elbląg, Polonya) gelen bu ortaçağ mühürleri ile Ipswich'in kendi şehir mührü arasındaki çarpıcı benzerliği görebiliyor musunuz? Podcast'in bu bölümünde de bununla ilgili daha fazla bilgi edinin.

Podcast'i iTunes, Spotify vb. üzerinden dinleyebilir ve abone olabilir veya çevrimiçi olarak yayınlayabilirsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

IPSWICH TARİHİ PODCAST BÖLÜM 5

ERKEN TARİH ÖNCESİ IPSWICH

Bu bölüm, Suffolk County Council Arkeoloji Servisi'nden Hannah Cutler ile erken tarih öncesi Ipswich hakkında bir sohbeti içeriyor.

Hannah, bir gün Ipswich olacak bölgenin Paleolitik (Eski Taş Devri) ve Mezolitik (Orta Taş Devri) sırasında nasıl olduğunu anlatıyor. Hannah ayrıca, bu alan için, halkın https://heritage.suffolk.gov.uk adresini ziyaret ederek keşfedebileceği çevrimiçi olarak tutulan bilgileri iyileştirmeyi içeren Tarihi Çevre Kaydı'nı güncellemek için şu anda yaptığı çalışmaları da anlatıyor. /

Ayrıca, öncü bir erken dönem kadın arkeolog ve antikacı olan Nina Layard'ın yaptığı da dahil olmak üzere, erken tarih öncesi buluntuların bazı tarihi yerel kazılarını da duyuyoruz.

iTunes, Spotify vb. üzerinden veya internet üzerinden yayınlayarak dinleyebilirsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Ipswich 1903-1905'te Foxhall Yolu kazısına öncülük eden Nina Layard, elinde kazma

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

IPSWICH TARİHİ PODCAST BÖLÜM 4

Orwell Nehri üzerindeki Orwell Köprüsü

Bölümü podcast'i iTunes, Spotify vb. üzerinden aratarak veya çevrimiçi olarak yayınlayarak dinleyebilirsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Bu bölümde Andy Parker ile Orwell Nehri'nin 1519'da Kral VIII.

Andy, River Orwell ve Ipswich'in şaşırtıcı denizcilik tarihini ve mirasını korumayı ve tanıtmayı amaçlayan Ipswich Maritime Trust için gönüllü olur. Andy, Ipswich Star için, Ipswich'e Orwell Nehri'nin nasıl verildiğini açıklayan bir makale yazdı ve bu bağlantıyı takip ederek okuyabilirsiniz:

Ayrıca babam David Howgego ile nasıl Ipswich'li bir Freeman olduğu ve Freeman'ın bugün (eğer varsa) hangi ek haklara sahip olduğu hakkında konuşuyorum.

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

IPSWICH TARİHİ PODCAST BÖLÜM 3

Podcast'lerin bu mini bölümü, Rushmere St. Andrew'daki Ipswich'in doğu eteklerinde bulunan Chestnut Pond'un tarihine ve kaçakçılıkla olan geçmiş bağlantılarına bakıyor.

Aynı zamanda, bir zamanlar Cat House adlı bir yerin Orwell Nehri'ndeki kaçakçılıkta nasıl rol oynadığına dair başka bir yerel hikayeyi de anlatıyor.

Bölümü iTunes, Spotify vb.'de bulabilir veya çevrimiçi olarak yayınlayabilirsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

BBC RADYO SUFFOLK RÖPORTAJI

Yakın zamanda Lesley Dolphin'in BBC Radio Suffolk programına bir kanepe konuğu olarak yerel tarih ve onunla nasıl ilgilenmeye başladığım hakkında konuşmam istendi. Bu, 16 Mart 2020'de yayınlanan programdaki röportajımın sesi.

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

ŞEHİR DUVARLARI

Ipswich her zaman bugün bulduğumuz nispeten barışçıl kasaba değildi. Bir zamanlar, hatta bazen kıta yağmacılarından gelen baskınlara maruz kaldı. Ortaçağ Ipswich halkının kasabalarına daha fazla güvenlik getirmeye çalıştıkları bir yol, bir savunma çevresi inşa etmekti. Bugün Ipswich'te antik bir şehir duvarının izi yok gibi görünüyor, peki şehir savunmaları nelerdi ve ne zaman ortadan kayboldular?

1203'te kasaba hendeklerinin kazıldığından bahseden bir kayıt hayatta kaldı, ancak bu daha eski bir savunma hattının uzatılmasına atıfta bulunuyor olabilir. Sonraki birkaç yüzyıla ait belgelerde şehir surlarına bazı göndermeler yapılırken, daha çok savunmalar “şehrin büyük hendekleri” olarak anılır. 1604'te surların üzerine çakıllı bir yol döşenmesi emri, bu noktadaki surların hepsinin olmasa da çoğunun taş duvardan ziyade toprak bir set olduğunu açıkça ortaya koyuyor. Bu nedenle, savunmaların, onları en zayıf noktalarında birbirine bağlayan duvarlarla bir dizi hendek ve toprak surlardan oluşması muhtemel görünüyor. Bu savunma hattı Ipswich'in batı, kuzey ve doğu kenarlarında kıvrılacaktı - şehrin güney kenarı Orwell Nehri'ne kadar uzanıyordu. Kasaba büyüdükçe, topluluklar surların dışında gelişti, ancak içeride yaşayanlar ayrıcalık için daha fazla vergi ödemelerine rağmen daha fazla güvenlik yaşadılar.

Taş duvarların kullanıldığı yerler çok az gibi görünse de, şehir surlarının çevresine aralıklarla yerleştirilmiş taş kapılar olduğu kesin. Ipswich tarihsel olarak askeri bir kaleden çok bir ticaret merkezi olmuştur ve kapılar güvenlik için olduğu kadar ticareti düzenlemek için de kullanılmıştır. Arabalar dolusu mal bu kapılara gelir ve daha sonra şehre girişine izin verilir veya girişi reddedilirdi. Bunların en etkileyicilerinden biri, siperli heybetli bir yapı olan ve 1448'de uzun yıllar hapishaneye de ev sahipliği yapmak üzere dönüştürülen Batı Kapısı'ydı.

John Speed'in 1610 tarihli haritasının dikkatli bir incelemesi, şehir surlarını gösterir (özellikle şehrin kuzeyi açıktır. Anahtar ayrıca çeşitli şehir kapılarını da listeler.

Westgate 1780'lerde yıkıldı ve 1900'lerin başında hemen hemen tüm surlar, hendekler ve kapılar ortadan kayboldu. Eski savunmalardan herhangi birinin görülebildiği son bariz yer, bazı Victoria Evlerinin toprak bir bankanın üzerine tünemiş olduğu şehrin kuzeyindeydi. Bu alan daha sonra düzleştirildi ve bir otopark için bir alana dönüştürüldü ve daha sonra Tower Ramparts'taki otobüs durağı oldu.

Tower Ramparts alışveriş merkezinin yeniden geliştirilip adı Yelkenciler olarak değiştirilmeden önce 2014 yılında çekilmiş bir fotoğrafı

Fiziksel kalıntılar yok olurken, surların ve kapıların hatırası bugün Ipswich'teki Tower Ramparts ve Northgate Street gibi yer ve sokak adlarında yaşıyor. Kuzey Kapısı'nın son izlerinin bu binanın mahzenine dahil edildiği söylendiğine göre, şimdi kasaba savunmalarından herhangi birini görmeye en yakın olan Halberd Hanı'nı ziyaret etmektir.

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

IPSWICH TARİHİ PODCAST BÖLÜM 2

2. Bölüm – 17th Century Ipswich ve Doğu Angliyen Cadı Avları

1645 yılında İngiliz tarihindeki en büyük cadı avı başladı ve Doğu Anglia acımasız merkezindeydi. Doğu Anglia'da, cadılık suçları iddiasıyla yargılandıktan sonraki birkaç yıl içinde yüzlerce insan asıldı. Bununla birlikte, Ipswich'te yaşayan Mary Lackland adında bir kadın, sözde suçlarından dolayı yakılmak gibi özellikle aşırı bir cezaya çarptırıldı.

Podcast'in bu bölümünde David Jones ile kitabı hakkında konuşuyorum Ipswich Cadısı, Mary Lackland ve Suffolk Cadı Avları.

17. yüzyılda Ipswich'te yaşayan insanlar için hayatın nasıl bir şey olacağı hakkında konuşuyoruz, David'in Mary Lackland'ın yargılanmasına ve infazına neyin yol açmış olabileceğine dair fikirleri, cadı bulucuları tarafından cadıların masumiyetini veya suçluluğunu test etmek için kullanılan yöntemler hakkında konuşuyoruz. ve 1640'larda cadı davalarının bu kadar aşırı bir düzeyde ortaya çıkmasının arkasında ne olabilirdi.

Podcast iTunes, Spotify ve diğer birçok podcast sağlayıcısında mevcuttur. Podcast uygulaması olan bir cihaza erişiminiz yoksa bu bağlantıyı takip ederek de dinleyebilirsiniz Ipswich History Podcast'ini dinleyin

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

50 BİNADA IPSWICH

Üzerinde çalıştığım yeni bir kitabın çağrıldığını duyurmaktan memnuniyet duyuyorum. 50 Binada Ipswich 15 Haziran 2019 tarihinde yayınlanacaktır.

Kitabın çıkışını 6 Temmuz Cumartesi günü saat 14:00'te Ipswich Müzesi'nde bir kitap imza etkinliği ile kutlayacağım ve burada kitap aynı zamanda müze dükkanından da satın alınabilecek. Hepinizi katılmaya davet ediyoruz – sizi orada görmek harika olur!

hakkında daha fazla bilgi edinmek isterseniz tanıtım yazısı burada. 50 Binada Ipswich:

Ipswich, Doğu Anglia'daki Orwell Nehri kıyısında bir yerleşim yeri olarak Anglo-Sakson köklerine kadar uzanan büyüleyici bir tarihe sahiptir. O zamandan beri kasaba, İngiltere'nin en önemli limanlarından biri, ortaçağ yün ticaretinin merkezi oldu ve Viktorya döneminde gelişen bir sanayi merkezine dönüştü. Ipswich'in kendine özgü tarihi, birbirini izleyen nesiller kendi mimari izlerini bıraktığı için, yüzyıllar boyunca şehri şekillendiren binalarda vücut buluyor.

50 Binada Ipswich Muhteşem ortaçağ kiliseleri ve Christchurch Mansion gibi Tudor hazinelerinden Willis Binası'nın çığır açan tasarımı gibi modern başyapıtlara kadar mimari mücevherlerinden oluşan bir seçki aracılığıyla şehrin zengin tarihini keşfediyor. Yazar ve tarihçi Caleb Howgego, Ipswich'in mimari mirasını yeni ve erişilebilir bir şekilde kutlarken, okuyucuya şehrin tarihi ve modern binaları hakkında rehberlik ediyor.

Bunu Paylaş:

Bunun gibi:

Fesleğen KAHVE ETKİNLİĞİ

Bileceğiniz gibi, bu blogu uzun süredir okuyan biriyseniz, Suffolk Arkeolog Basil Brown'ın büyük bir hayranıyım. Bu yılın başlarında onunla ilgili bir podcast yaptım, buradan dinleyebilirsiniz.

25 Kasım 2018 Pazar günü, saat 14.15-3.15'te Ipswich Müzesi'nde Basil Brown (bir zamanlar Ipswich Müzesi'nde Müze Görevlisiydi) hakkında bir Müze Sırları etkinliğine liderlik edeceğim. Ücretsizdir ve katılımlı bir etkinliktir, dolayısıyla katılmak için rezervasyon yaptırmanıza gerek yoktur.

Etkinlik hakkında daha fazla bilgiyi şu bağlantıyı takip ederek bulabilirsiniz: Müze Sırları – Basil Brown: Suffolk's Arkeolog


Altıncı form

A Level History, analiz becerilerinizi ve ikna edici, anlaşılır argümanlar yazma yeteneğinizi geliştirecek ilginç ve zorlu bir kurs sunar. Sanat, Sosyal Bilimler veya Bilim derecesine başvuruyor olun, rekabetçi üniversiteler tarafından iyi kabul edilen bir niteliktir.

Uzmanlık alanlarında çalışan öğretmenler tarafından teşvik edileceksiniz. Dersler, bölüm tarafından yazılmış materyaller kullanılarak ve çok çeşitli ilgili kitaplarla desteklenerek verilmektedir.

Kendi ilgi alanlarınız geliştikçe daha fazla okuma yönünde yönlendirileceksiniz. Hem akranlarınızla hem de öğretmenlerinizle tartışmaya ve tartışmaya teşvik edileceksiniz. Zamanla, bağımsız olarak çalışmanız ve kendi kendine yeterli bir öğrenci olmanız da beklenecektir. En önemlisi, modern Tarihin en büyüleyici ve tartışmalı yönlerinden bazılarını ele alacaksınız.

12. Yıl'da, İkinci Dünya Savaşı'nın nedenleri hakkındaki tarihsel tartışmayı da içeren, 1918-1989 arası Almanya ve Batı Almanya tarihini inceliyoruz. Buna İtalya'da Faşizmin Yükselişi ve Düşüşü c1911-1946'yı ele alan bir makale eşlik ediyor. 13. Yılda İrlanda ve Birlik c1774-1923 arasındaki ilişkiyi ele almaya devam edeceğiz. Öğrencilerin Holokost ile ilgili tarihsel bir tartışma üzerine bağımsız bir çalışma üretecekleri bir kurs modülü de bulunmaktadır.

Sınav kurulu Edexcel'dir. Sınavlara kadar olan süreçte kapsamlı bir revizyon programı sunulmaktadır.

"Leeds Üniversitesi'nden Uluslararası Tarih alanında Birinci Sınıf bir derece kazandım … ve bunun sizin sürekli desteğiniz ve teşvikiniz olmadan mümkün olmayacağına gerçekten inanıyorum." Eski A Level Tarih öğrencisi.

Ipswich Okulu Tarih Bölümü'nü twitter @IpswichHistory'den takip edin.

Sınav sonuçları

Son üç yıllık dönemde Tarih'teki sonuçların ortalaması:


Tarih

Aslen amaca uygun olarak inşa edilmiş bir geç Viktorya binasında, müze, kütüphane ve sanat galerisinin işlevleri birleştirildi. Kütüphane 20. yüzyılın başlarında kaldırıldı, ancak Sanat Galerisi ve Müze, binaları 1970'lere kadar paylaşmaya devam etti.

İlham Olarak Müzeler

Müze ve Sanat Galerisi birbirine bağlandığında, müze koleksiyonları hem öğrencilerin hem de personelin çalışmalarına doğrudan ilham kaynağı oldu. Maggi Hambling'in ilk eserlerinden bazıları ve Bernard Reynolds'un kuş heykelleri bariz bir bağlantı sağlar.

Diğer birçok sanatçı, özellikle modern müzelerin kökenini oluşturan ve ruhu Pitt Rivers veya Victorian Gallery gibi bazı modern müzeleri aşılamaya devam eden 'Cebines of Curiosities' fikri başta olmak üzere müze koleksiyonlarından ilham aldı ve olmaya devam ediyor. Ipswich Müzesi'nde. Damien Hirst'ün ilk çalışmaları bu temadan doğrudan ilham aldı.

Mark Dion gibi bir dizi önde gelen sanatçı, eserlerine kaynak olarak bilimsel ve müze kataloglama ve sınıflandırma fikirlerini ve sistemlerini kullanmaya devam ediyor.

Bir müzenin, özellikle de Merak Kabinesi fikrinin ve çağdaş sanatın evliliği, uzun ve saygın bir geleneğe ve yeni birleşik mekanda somutlaşmaya devam edebilecek bir şeye sahiptir.

20. Yüzyıl Sanatı

Benton End Grubu (bazen Doğu Angliyen Resim ve Çizim Okulu olarak da adlandırılır) Cedric Morris (1889-1982) ve Arthur Lett Haines (d.1978) tarafından ilk olarak 1937'de Dedham'da ve 1940'tan 1970'lerin sonlarına kadar Benton'da açılmıştır. End, Hadleigh Suffolk yakınlarında. Birçok Suffolk ressamı üzerinde büyük bir etkisi oldu ve kırk yıl boyunca İngiltere'nin doğusunda sanat öğretimine hayati bir katkı yaptı.

Benton End çok kendine özgü hatlarda çalıştırıldı. Resmi bir öğretim yoktu, daha çok sanatçıların potansiyellerini keşfedebilecekleri bir ortamın kurulması vardı. Atmosfer birçok sanatçıya ilham verdi ve diğerlerinin yanı sıra Lucien Freud ve Maggi Hambling'in ilk kariyerlerinde biçimlendirici bir deneyim oldu. Ipswich'teki koleksiyonda, Cedric Morris, Arthur Lett-Haines, Maggi Hambling, Lucy Harwood, Joan Warburton ve Glyn Morgan da dahil olmak üzere Benton End ile ilişkili sanatçılar tarafından zaten birkaç resim var. Cedric Morris ve gruptan etkilenen diğer önemli isimler arasında Beth Chatto da vardı.

Ipswich Sanat Okulu ayrıca, koleksiyonda temsil edilen Bernard Reynolds, Leonard Squirrel, Lawrence Self ve Colin Moss da dahil olmak üzere birçok yetenekli sanatçı, heykeltıraş ve matbaacıyı kadrosuna çekti. Bazı önemli öğrenciler Maggi Hambling ve Brian Eno'dur.

İki okulun yakınlığı, aralarında Maggi Hambling ve Bernard Reynolds'un da bulunduğu birçok sanatçının her ikisiyle de bağlantıları olduğu veya aralarında kesiştiği anlamına geliyordu. Şu anda, Cedric Morris de dahil olmak üzere bu sanatçıların bazılarının eserlerini hem sanatlarının örnekleri olarak hem de nasıl çalıştıklarının illüstrasyonları olarak önemli ölçüde artırmak için bazı fırsatlar var.


Ipswich, Suffolk

1551'deki ölümünde, varlıklı tüccar Henry Tooley, Ipswich'in yoksullarına yardım ve barınma sağlamak için kullanılmak üzere büyük bir meblağ bıraktı. 1569'da, onun adına kurulan vakıf, şimdilerde Foundation Caddesi olan eski Dominik manastırını satın alarak, İsa'nın Hastanesi olarak bilinen, kasabanın ilk bakımevinin ne olduğunu etkili bir şekilde kurdu. Hem 'masum' yoksulları (yaşlı, yetim, dul ve hasta) hem de 'tembel' yoksulları (serseriler, serseriler ve dilenciler) içeren 40 mahkumu barındırabilir. 1574 yılında, sahada büyük bir yeniden yapılanma gerçekleşti ve 40 kişiye tarak, eğirme ve dokuma gibi işler sağlamak için atölyeler dahil edildi. 1601 Yoksullara Yardım Yasası'nın kabul edilmesinin ardından, bireysel cemaatlere yardım etme sorumluluğunu yükleyen Christ's Hospital, bir belediye bakımevi olmaktan çıkmış ve bunun yerine yoksul çocukları eğitmek için bir yardım okulu rolünü üstlenmiş görünüyor.

1777 tarihli bir parlamento raporu, Ipswich'te faaliyette olan bir düzine mahalle bakımevini sıraladı: St Clement (70 mahkuma kadar konaklama imkanı ile), St Helen (10), St Lawrence (25), St Margaret (100), St Mary at Elms ( 10), St Mary at the Key (25), St Mary Stoke (30), St Mary Tower (30), St Matthew (30), St Nicholas (20), St Peter (28) ve St Stephen (24) .

1834'ten sonra

Ipswich Poor Law Union, 9 Eylül 1835'te kuruldu. Onun işleyişi, aşağıda listelendiği gibi 14 kurucu mahalleyi temsil eden, 20 adet seçilmiş bir Muhafızlar Kurulu tarafından denetlendi (parantez içindeki rakamlar, birden fazla ise Muhafızların sayısını göstermektedir):

Suffolk İlçesi: St Clement's (3), St Helen, St Lawrence, St Margaret (3), St Mary-at-Elms, St Mary-at-the-Quay, St Mary Stoke, St Mary-at-the-town, St Matthew ( 2), Aziz Nicholas, Aziz Peter (2), Aziz Stephen, Westerfield, Whitton.

1831 nüfus sayımında Birlik'e düşen nüfus 20.528 idi ve Whitton'dan (nüfus 346) St Clement's'e (4.779) kadar değişiyordu. 1833-35 dönemi için ortalama yıllık düşük oranlı harcama & pound 13.685 veya 13s.4d idi. nüfusun başına düşen

Büyük Kırbaç Sokağı Yetimhanesi

Yeni Ipswich Birliği, bir bakımevi inşa etmek amacıyla, Christ's Hospital'dan Great Whip Caddesi'nde 3.5 dönümlük bir araziyi 525 pound karşılığında satın aldı. St Peter'ın çalışma evi olarak bilinen, 1836-7'de 6,585 pound maliyetle inşa edildi ve 400'e kadar mahkumu barındırması amaçlandı. Mimar, Hartismere ve Bury St Edmunds'daki çalışma odası genişletme planlarından da sorumlu olan William Mason'dı.

Great Whip Street binası kırmızı tuğladan inşa edilmiştir. Düzeni genel olarak popüler haç veya "kare" tasarımını takip etti. Great Whip Caddesi'ndeki giriş bloğu, yönetim kurulu odasını ve kabul koğuşlarını içeriyordu. Arkada, merkezi bir sekizgen göbekten yayılan dört konaklama kanadı. Dış çevre, tek katlı atölyeler ve müştemilatlardan oluşturulmuştur. Daha sonra binanın arkasına bir şapel ve ayrıca bir revir bloğu eklenmiştir. Aşağıdaki 1884 haritasında tımarhanenin yeri ve düzeni gösterilmektedir.

Ipswich Great Whip Street çalışma evi sitesi, 1884.

Heath Road Yetimhanesi ve Revir

1898-9'da, Woodbridge Yolu'nun güney tarafındaki yeşil bir alana yeni bir pavyon planlı bakımevi ve revir dikildi. Tasarımı yarışmaya açıldı ve kazanan planlar Stephen Salter ve H Percy Adams tarafından Lister Newcombe ile sunuldu. İnşaat işleri 1896'da başladı, inşaatçılar George Grimwood & Son, iş için 25,773 sterlinlik bir fiyatla sözleşme imzaladılar. 369 mahkûmu barındırabilecek yetimhanenin nihai maliyeti 30.000 poundun üzerindeydi. Bir mimarın çizimi, sitenin kuşbakışı görünümünü gösterir.

Ipswich kuzeyden yeni tımarhane ve revir, 1899.

Alanın kuzey batısındaki bir alıcı blok, bir kapıcı locasını, koğuşları ve serseri hücrelerini içeriyordu. Birinci katta yoksulların kıyafetleri için bir kiler odası bulunuyordu.

Kuzeydoğudan Ipswich giriş köşkü, 2001.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Kuzeydoğudan Ipswich resepsiyon bloğu, 2001.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ana darülaceze binası, batıda erkekler, doğuda kadınlar için olmak üzere iki katlı kanatlara koridorlarla bağlanan merkezi bir yönetim bloğundan oluşuyordu. Her kanadın zemin katında kreşler, banyolar, tuvaletler, yatakhaneler ve hastalar için oturma odaları vardı. Birinci katta yatakhaneler vardı. Merkez bloğun önünde komite odası ve ustaların odası vardı. Merkez bloğun arkasında, aynı zamanda bir şapel olarak da hizmet veren 270 kişilik bir yemek salonu vardı.

Darülaceze revir sitenin güneyinde duruyordu.

Güneydoğudan Ipswich reviri, 2001.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Site konumu ve düzeni aşağıdaki 1903 haritasında gösterilmektedir.

1930'da tımarhane reviri Ipswich Borough Genel Reviri oldu ve tımarhane bölümü Heathfields Kamu Yardım Kurumu olarak devam etti. 1955 yılında site Ipswich Genel Hastanesi Heath Yolu Kanadı oldu. Ana tımarhane binası yıkılmış ancak diğer bloklardan birkaçı ayakta kalmış.

Batıdan Ipswich eski giriş sitesi, 1950'ler.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ebeveynleri 1937'den 1946'ya kadar Heathfields'tan sorumlu olan Peter Collier şöyle hatırlıyor:

Ailem ve ben 1937'de buraya taşındık ve 1946'da Salford'a taşınana kadar burada kaldık. Babam eski tımarhanenin efendisi olarak atandı ve savaş sırasında aynı zamanda laik idari işlerden sorumlu hastanenin Vekilharcı olarak atandı. Hastanede ayrı bir hemşire vardı.

Huzurevinin orta bloğunda hem bakımevi hem de revir için yiyecek ve içecek sağlayan büyük bir çamaşırhane vardı. Bir de büyük bir mutfak vardı ama bunun her iki bölüme mi yoksa sadece çalışma odasına mı hizmet ettiğini hatırlayamıyorum. Kurumun ayrıca hastanenin güneyinde hem ekilebilir hem de hayvancılık (kesin sığır ve domuzlar ve bazı çalışan atlar olabilir) içeren bir çiftlikten oluşan geniş bir arazisi vardı. Meyve bahçeleri de vardı. Yetimhanenin, yetenekli mahkûmlar tarafından yapılan el işlerini denetleyen bir işçi ustasının kontrolü altında bir 'işçi avlusu' vardı, örn. günlükleri testere.

Aşağıdaki fotoğraf, babamın 1937 yılı civarında çektiği imarethanenin ön cephesine ait. Konaklamamız sol zemin kat ve birinci katın tamamını kapsıyordu.

Güneydoğudan Heathfields giriş bloğu, c.1937.
&Peter Collier'ı kopyalayın.

1912 "Atölye Balosu"nun aşağıdaki resmine bakılırsa, en azından personel ve Muhafızlar söz konusu olduğunda, tımarhanedeki yaşam tamamen sosyal olaylardan yoksun değildi. Bununla birlikte, duvarları süsleyen metinler, işlemlerle biraz çelişiyor gibi görünüyor.

Ipswich Yetimhanesi Balosu, 1912.
&Peter Collier'ı kopyalayın.

St John's Çocuk Evi

Yoksul çocuklar için ayrı bir ev ilk olarak 1870 civarında Ipswich Union tarafından önerildi. Bu, o zamanlar metropol olmayan sendikalar için alışılmadık bir adımdı ve Great Whip Street çalışma evindeki yer sıkıntısının sonucu olabilir. 1871 ve 1873'te, kız ve erkek çocukların konaklamasını içeren ayrı kanatlarla çevrili merkezi bir bloğu olan uzun bir bina için planlar üretildi. Sonunda 1879'da Bloomfield Caddesi'nde inşa edilen bina, 80 erkek ve 50 kız çocuğunu ağırladı. Oğlanlara toprakta, terzilik, ayakkabıcılık ve marangozlukta çalışmaları öğretildi. Kızlara, ev hizmeti için onları donatmak için iğne işi ve diğer ev becerileri öğretildi. Küçük bir revir sonradan eklenmiştir.

Ipswich St John's Çocuk Evi, 1927.

Ipswich St John's Çocuk Evi, c.1910.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Çocuk Evi, c.1910.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Children's Home marangozluk atölyesi, c.1910.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Çocuk Evi, 1900'lerin başı.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Çocuk Evi, 1900'lerin başı.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Çocuk Evi, 1900'lerin başı.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Çocuk Evi, 1900'lerin başı.
&Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Daha sonra Freelands olarak bilinen mülk, 1970'lerde yıkıldı. Site şimdi bir toplu konut tarafından işgal edilmiştir.

Kadro

Mahkumlar

Kayıtlar

Not: Birçok arşiv, bireyleri tanımlayan kayıtlar için 100 yıla kadar bir kapatma süresi uygular. Uzun bir yolculuğa çıkmadan önce, her zaman danışmak istediğiniz kayıtların mevcut olup olmadığını kontrol edin.

  • Suffolk Kayıt Ofisi, Gatacre Yolu, Ipswich IP1 2LQ. Holdingler şunları içerir: Koruyucuların tutanakları (1835-1930) Doğumlar (1836-1938) Ölümler (1836-1933) İnanç kayıtları (1906-50) St John's Children's Home inanç kayıtları ve kayıt defterleri (1882-1950) vb.

Bağlantılar

Teşekkür


Aksi belirtilmedikçe, bu sayfanın () telif hakkı Peter Higginbotham'a aittir. İçerikler izinsiz çoğaltılamaz.


Tarih

1689'a kadar uzanan kayıtlara göre, şimdi Ipswich Inn olan mülk, çok sayıda evin yeri olmuştur. Aslen, mülkü Robert Paine'e satan Bay Thomas Bracy'nin sahibi olduğu bir tuğla evdi, 'Elder to you Ipswich kilisesi'. Kayıtların bildirdiği gibi, o, toplumun eğitimde ilerlemesi için gayret gösteren en önde gelen bir adamdı. 1689'da Bay Paine, malikanesini ve meyve bahçesi, bahçesi vb. bulunan üç dönümlük araziyi oğlu Robert Paine Jr.'a devretti, 12 Şubat 1689 (IPS. Tapu 5:590).

Bir yıl sonra, iki ve üç çeyrek dönümden oluşan mülk, Bay Francis Wainwright'a satıldı, 30 Eylül 1690 (Ips. Deeds 5:326). göçmen, gençliğinde Pequot savaşında büyük bir ayrıcalıkla hizmet etti. Müreffeh bir tüccar ve önde gelen bir vatandaş oldu. 19 Mayıs 1692'de öldü.

Francis adlı oğlu, 1686'da Harvard Koleji'nden mezun oldu. Bir alayın Albay, Kasaba Katibi, Genel Mahkeme Temsilcisi, Feoffee ve Genel Oturum Mahkemesi Yargıcıydı. 3 Ağustos 1711'de öldü.

Yaşının kırk sekizinci yılında, 1740 yılında mülk yeniden Yüzbaşı Thomas Staniford'a satıldı. Kayıtlara göre, Kaptan Staniford, 28 Şubat 1740'taki ölümüne kadar evi işgal eden bir "beyefendi" idi. Vasiyeti 7 Eylül 1778'de dosyalandı (Pro. Rec. 353: 206) ve mülkünün envanteri, 9 Aralık 1778'de dosyalandı (353: 316), Devrim döneminin güzel konaklarından birinin mobilyalarını, o dönemde hüküm süren şişirilmiş değerlerde ortaya koyuyor. O günün bir beyefendisinin gardırobunu ve çeşitli mobilya ürünlerini belirleyen bazı öğeler ilgi çekicidir.

Kaptan Thomas Staniford'un oğlu da bir Kaptandı ve adı James'ti. Yüzbaşı James Staniford, genellikle "eski tuğla" olarak anılan, uçları tuğla olduğu için konağı işgal etti ve bir han işletti. Ayrıca Richard Dummer Jewett'ten, 28 Mayıs 1803'te (172: 178) bitişik arazinin beş ve dörtte üçü dönümlük arazinin bölünmemiş yarısını satın aldı.

James Staniford ve oğlu James'in mirasçıları, "tuğla evi" ve sekiz buçuk dönümü Dr. Thomas Manning'e sattılar, 10 Haziran 1830 (259: 76). Dr. Manning "eski tuğlayı" oğlu Charleston, SC'den Dr. Joseph Manning'e sattı, 27 Aralık 1830 (266: 73) ve onu John Jewett'e devretti, 9 Aralık 1835 (290: 121) ). Bay Jewett, hala mükemmel bir şekilde korunmuş olan eski konağı yıktı ve yerine, birkaç yıl önce satın alınan ve Bay John B. Brown ve Bay Harry B. Brown tarafından yıkılan tuğla konutu inşa etti.

Mülk, birkaç aileden daha geçti ve sonunda 27 Mart 1814'te, lotunu Metodist Piskoposluk Kilisesi'nin mütevellilerine satan Susanna Wilcomb'a aitti. Daha sonra bu mülkün üzerine bir toplantı evi inşa edilmiş ve mevcut kilise inşa edilinceye kadar kilise tarafından kullanılmıştır. Parti daha sonra Metodist Piskoposluk Kilisesi'nin mütevelli heyeti tarafından 17 Mayıs 1862'de Robert Jordan'a satıldı. Robert Jordan, savaştan sonra genel bir tüccar olarak geçimini sağlayan bir İç Savaş gazisiydi. Bay Jordan bu evi 1863 yılının Nisan ayında inşa etti. Yıllar sonra evin sahibi, evin arka tarafındaki ofisinde hastalarını tedavi eden yerel bir doktor olan Dr. Bailey'e aitti.

Robert Jordan evi, tarihi Ipswich'in merkezinde bir dönüm arazi üzerinde yer alan İtalyan tarzı bir Viktorya döneminin güzel bir örneğidir. Mülkün arka tarafında, 1800'lerin başında Ipswich'te gelişen ipekböceği/ipek endüstrisi için dut çalıları yetiştirmek için geliştirilen teraslı arazi bulunmaktadır. Interesting architectural features of the house include the Belvedere on the third-floor roof, the curved front stairway, original ceiling moldings, and the ice house at the rear of the main house, which was part of the &ldquosummer kitchen&rdquo. The carriage house is at the back of the property.

Margaret and I bought this house in 1996. We had been on Pleasant Street for twenty-two years, and after our three kids grew up got married, Margaret decided we needed more room. A bed and breakfast was not in our plans but we began to think of the fun it would be meeting new people, and sharing our home with strangers that wanted to pay us for being here (a no-brainer). So, out of those thoughts and dreams, came our B&B, which grew to become The Ipswich Inn.

This is our 20th year. All we wanted and wished for has come true. This has been a great adventure that continues to bring more and more people into our lives that have become friends. We truly hope your stay with us and your meal will be as pleasant and restful as the joy we have in bringing it to you.


The Regent Theatre Ipswich opened in 1929 as a cine-variety hall. At 7.00pm on Monday November 4th, the entrance doors of the new Regent, Ipswich opened and into its spacious foyer crowded nearly 2,000 Ipswich people who had come to witness this momentous occasion.

Ipswich Regent Theatre Opening Night 1929

Opening night screening of The Last of Mrs. Cheyney

1963 Show Poster for The Beatles Headlining at the Ipswich Regent Theatre then known as The Gaumont

The Beatles Headlining at the Ipswich Regent Theatre in 1963 then known as The Gaumont

Outside the theatre a large queue had formed, filing past Botwoods Garage. As a Ransomes steam lorry tooted its whistle, the staff of the Regent lined up for their first inspection by the manager, Albert E. Crabb who checked their ‘electric’ torches.

On the stage, the Mayor of Ipswich, Dr Hossack, performed the opening ceremony musical numbers were played on the brand new Wurlitzer organ by the resident organist Frank Newman F.R.C.O. that included the Merry Wives of Windsor by Otto Nicolai. The film chosen to open the venue then began – “The Last of Mrs Cheyney” starring Norma Shearer and Basil Rathbone – an ‘all-talking’ picture with front circle seats costing 2s / 4d.

The luxurious Regent restaurant enhanced a visit to the theatre and, if desired, tea could be served in any of the fourteen boxes at the rear of the stalls. The boxes and the Manager’s cottage at the rear of the theatre are unique features of the Regent.

Before World War II, the stage was not used to any great extent, although up to the mid-1930’s, the 18 piece Regent Orchestra, under the direction of Louis Baxter frequently entertained the audiences. Most theatre orchestras were disbanded in the late 1930’s and the organ then became the principal musical attraction.

During the war the Regent provided much needed escapism and helped sustain public morale. After the war, The Regent flourished and enjoyed an attendance boom. Also during this period, the stage was employed in the presentation of Ipswich Civic Concerts. The stage was also used for the presentation of Sadler’s Wells Ballet, Carl Rosa Opera and one-night band shows.

The popularity of cinema in the 1930’s and 40’s was so great that another cinema in Ipswich, The Ritz, was opened in 1937. But the advent of television in the 1950’s proved a testing time for cinemas up and down the country and even the highly successful Regent, by now known as the Gaumont, did not survive intact. To allow the cinema to become more profitable, the restaurant was closed down and replaced by the Victor Sylvester Dance Studio.

In the late 1950’s the ‘pop’ music phenomenon exploded. Buddy Holly and the Crickets started off the craze at the Gaumont and since then thousands of international artists have graced the theatre’s stage including the Beatles, Tina Turner, The Bay City Rollers, Tom Jones, Chris Rea, Status Quo and many of today’s top artistes.

From 1958, local musicians and dramatic societies were encouraged to perform at East Anglia’s largest theatre. These included the Ipswich Operatic Society, the Gilbert and Sullivan Society and later the Co-op Juniors. The programme has since included a wide range of productions including professional touring theatre, opera, ballet, comedy and full-scale orchestras.

By 1965 the proprietors, The Rank Organisation, were sufficiently confident of the future to spend £50,000 on a major modernisation and redecoration programme. But by the 1970’s, the large cinemas that had been so successful in the 30’s and 40’s proved to be less economically viable.

The Gaumont’s dance studio was converted to a luxury 200-seat cinema, which could be rented out for use by the local business community. Rank also proposed to convert the main auditorium to a multi-screen complex. However, after a great deal of persuasion, Rank’s plans were abandoned because the auditorium was established as the only local venue of sufficient capacity to stage live shows and concerts despite its limited performance facilities.

The theatre was re-launched in September 1991 after Ipswich Borough Council successfully negotiated the ownership from the Rank Organisation and NCP. Today, Ipswich Borough Council continues to fund the theatre as part of its arts and entertainment portfolio which also includes the Corn Exchange and Ipswich Film Theatre.

Based on an article written by David Lowe, Manager 1958-1989.


Materials and methods

Nanopore sequencing and datasets

Nanopore sequencing data for NA19240 [26], NA12878 [24], and Ashkenazi trio [29] human cell lines are publicly available. A complete description of the datasets, their base calling, mapping, and usage in our study are provided in additional file 1 along with the link to the sources.

We also sequenced the Colo829BL B-lymphoblast cell line using one nanopore PromethION flow cell and Illumina paired-end sequencing at 30× coverage. A complete description of nanopore and Illumina sequencing protocols and data obtained is also provided in Additional file 1.

CpG methylation calling from nanopore data

To call CpG methylation, we benchmarked three model-based approaches: Nanopolish [10], Megalodon [14], and DeepSignal [15]. Nanopolish uses a hidden Markov model to call CpG methylations from raw nanopore data while Megalodon and DeepSignal use neural networks. We called CpG methylation using these tools (with the default parameters) for 12 flow cells of NA12878 publicly available data (Additional file 1) and compared the results with WGBS data from ENCODE project (ENCFF835NTC) [51] and Human Methylation 27 (27k) array from Fraser et al. [25].

Variant calling

We used Clair to call SNVs [22]. We called variants for each chromosome using clair.py callVarBam --threshold 0.2 ve HG122HD34 model. Indels were filtered out. To evaluate variant calling, we compared SNVs called by Clair from nanopore data to those from 1KGP phase 3 [30] (GRCh37 coordinates). Clair’s variant calls were lifted over to GRCh37 human reference genome coordinates using CrossMap [52] for comparison to 1KGP data.

For our in-house Colo829BL sample, we compared Clair variant calls to Strelka [53] v 2.9.10 calls made from paired-end Illumina reads (Additional file 1).

Model training to improve SNV calling

We calculated average qualities and mutation frequencies for each position of each 5-mer window containing an SNV. Mutation frequencies were calculated as the number of instances over coverage for each genomic position in the 5-mer window. Base qualities for a given position were calculated as the average of all base qualities mapped to the position. We used these as inputs to a fully connected artificial neural network classifier composed of four hidden layers with a relu activation function. The first hidden layer is six times larger than the input layer and the size of subsequent hidden layers decreases through a factor two.

We trained three models to compare the classifier using different coverages. NA12878 20 flow cells (24×), NA12878 all flow cells (44×), and HG003 (80×) were used for training. First, we called variants for each dataset using Clair and then determined true and false positives using high-quality variants using the Genome in a Bottle database (GIAB) [27]. Using NA12878 20 flow cell data, a randomly selected balanced dataset of 25 million 5-mers was used for training and 4 million unseen randomly selected 5-mers were used as the validation set. For the NA12878 whole dataset and HG003 sample, the training datasets were 18M and 14.9M, respectively, and validation sets were 2.5M and 2M, respectively (Additional file 2: Fig. S6). The NA12878 20 flow cell model was used for < 30× coverage data, NA12878 all flow cells for 30×–45× coverage data, and HG003 model for > 45 coverage data.

Phasing single nucleotide variants detected from nanopore sequencing

In order to phase nanopore reads and CpG methylation, we first called SNVs for both samples (NA19240 run 1 and Colo829BL) using Clair [22], then used SNVoter to normalize the quality scores and filter out false positives (Fig. 2e and Table 1). Finally, we used WhatsHap [23, 31] v0.18 with the default parameters and --ignore-read-groups on to determine haplotype status for each SNV.

Phasing of nanopore reads and CpG methylations

Phased SNVs and CpG methylation calls were leveraged to phase reads along their CpG methylation to diploid haplotypes. After filtering out a considerable number of false-positive SNVs using SNVoter, we still noticed 10–20% false-positive SNV calls in the datasets (Table 1). These unfiltered false-positive calls, in addition to sequencing errors, can result in reads incorrectly mapping to the SNVs from haplotype 1 when the read would actually belong to the haplotype 2 and vice versa. We noticed reads presenting SNVs from both haplotypes when mapping them to phased SNVs. In NA19240 run 0, out of

3M reads which mapped to at least one phased SNV,

2M reads had SNVs from both haplotypes (Additional file 2: Fig. S7a). To further overcome false positives and the sequencing error problem, we made several filtering steps to account for remnant false-positive SNVs and haplotype ratio (number of SNVs from HP1/HP2 or HP2/HP1). As we analyzed NA19240 run 0, we noticed a lower base quality distribution for false-positive SNVs compared to true positives that could not be filtered out by SNVoter (Additional file 2: Fig. S7b). Therefore, we assigned a minimum base quality threshold to successfully map each read at a phased SNV position. To manage reads containing SNVs from both haplotypes, we defined another threshold, the haplotype ratio, which ensures the reads are assigned to a single haplotype. Based on the quality distribution of SNVs (Additional file 2: Fig. S7b), the proportion of false positives which is between 10 and 20% (Table 1) and haplotype ratios (Additional file 2: Fig. S7a), and also based on empirical phasing at a few known imprinted regions, we used seven as the minimum base quality and 0.75 as haplotype ratio. We also used two as the minimum number of phased SNVs a read must present to be considered for phasing. In order to assign a read to a defined haplotype, a read must satisfy the following criteria:

As the reads are separated to different haplotypes, their associated CpG methylations from processed methylation call file are also separated to the corresponding haplotypes. We have integrated all the steps and filters in our python3 command-line tool, NanoMethPhase. Users can input methylation call data from Nanopolish, phased variant calling file, alignment file, and reference genome to NanoMethPhase (Fig. 3c). NanoMethPhase will output phased reads in aligned format, phased mock WGBS converted format for visualization (see the “Visualization” section Fig. 4c, d), phased methylation calls, and methylation frequency files. The latter can be used for differential methylation analysis to detect DMRs between haplotypes.

Differential methylation analysis

After phasing reads and CpG methylation to haplotypes, NanoMethPhase can perform DMA to detect mono-allelic methylated regions. It uses the DSS R package [36] for DMA. Users can perform all analyses in a command-line interface and directly perform DMA using the dma module of NanoMethPhase on the output phased methylation frequency data to detect DMRs.

Görselleştirme

NanoMethPhase can convert phased reads into separate mock-WGBS bam files using the processed methylation call file from its methyl_call_processor module. Each cytosine in each CpG in each read is converted to a T, A, or N depending on the CpG being called as methylated, unmethylated, or uncalled. These pairs of files can be loaded into a genome browser such as IGV [34] in bisulfite mode for visualization (Fig. 4c, d).


Yöntemler

Strains and growth conditions

Escherichia coli DH5α was used for plasmid amplification. T. reesei Rut-C30 (ATCC 56765), NG14 (ATCC 56767), and PC-3-7 (ATCC 66589) were purchased from ATCC (American type culture collection). T. reesei strain QM6a (ATCC 13631), QM9414 (ATCC 26921), and RL-P37 (NRRL 15709) were respectively purchased from DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen), Institute of Microbiology-Chinese Academy of Sciences, and NRRL (Agriculture Research Service Culture Collection). E. coli was cultured in Luria broth (LB) medium. All the strains of T. reesei were cultivated at 28 °C (200 rpm) in 2× Mandels’ medium (1.0 g/L yeast extract, 3 g/L peptone, 0.6 g/L urea, 2.8 g/L (NH4)2SO4, 4.0 g/L KH2PO4, 0.5 g/L CaCl2, 0.6 g/L MgSO4∙7H2O, 5 mg/L FeSO4∙7H2O, 1.6 mg/L MnSO4∙4H2O, 1.4 mg/L ZnSO4∙7H2O, and 20 mg/L CoCl2∙6H2O) in which 2% glucose, 2% lactose, or 1% (w/v) Avicel was used as carbon source [31]. In addition, all these strains were maintained on potato dextrose agar (PDA) plates at 28 °C for the generation of conidia.

Plasmid construction, Agrobacterium-mediated transformation, and transformants screening

The primers used in this study are listed in Additional file 8: Table S2. LML2.1 [32] was used as a skeleton for the two plasmids, plasmidA734 and plasmidA723, to obtain two types of transformants bearing the ACE3-734 and ACE3-723 protein, respectively. The 5′- and 3′-arms of the homology double exchange for ACE3-734 and ACE3-723 sequences were constructed as described by Zhang et al. [26]. The DNA fragment of the 5′-arm of truncated ACE3-723 (approximately 900 bp) was cloned using the genome of Rut-C30 and the primer pair ace3-1/ace3-2723. Similarly, the fragment of the 5′-arm of native ACE3-734 (approximately 1000 bp) was cloned using the QM6a genome and the primer pair ace3-1/ace3-2734. The 3′-arms of these structures (about 1000 bp) were amplified from Rut-C30 or QM6a genomic DNA using the primer pair ace3-3/ace3-4. KOD-Plus-Neo (TOYOBO, Japan) was used for PCR. Next, the 5′- and 3′-arms of ACE3-723 and ACE3-734 were ligated in an orderly manner into PacI/XbaI and SwaI sites of linearized LML2.1 [32] to form PlasmidA723 and PlasmidA734, sırasıyla. The transformation experiments were performed using Agrobacterium-mediated transformation as described by Zhang et al. [32]. Correct intermediate transformants of A723 and A734, obtained by a homologous double exchange, were checked by diagnostic PCR [33] and quantitative PCR (qPCR Additional file 2) [34,35,36] to avoid unspecific locus integration (ectopic integration events). The primer pairs ace3-CF/D70-4 and HG3.6/ace3-CR were used in diagnostic PCR (Additional file 3: Figure S2A-B), which was followed by DNA sequencing (Additional file 3: Figure S2E) to confirm the correct knock-in at the ace3 locus in T. reesei genomes. The single-copy DNA fragment integration in transformed clones was verified by qPCR (Additional file 3: Figure S2C-D). The hygromycin marker gene in the transformants was excised using xylose-induced cre recombinase expression [32], and then the intermediate transformants were turned into the final transformants by excising the hygromycin marker gene. The final transformants were obtained and confirmed by hygromycin sensitive phenotype and with the second-round diagnostic PCR. Thus, the final A723/A734 transformants were used for further analysis.

Cellulase production in a shake flask and fermenter culture

Cellulase production in a shake flask was conducted according to a previously described method [26], with some modification. In brief, conidia (final concentration 10 6 /mL) of T. reesei strains were grown at 28 °C, in 20 mL of 2× Mandels’ medium containing 2% (w/v) lactose or 1% (w/v) Avicel (PH-101, Sigma-Aldrich) as the sole carbon source. The biomass dry weights were indirectly measured by calculating the total amount of intracellular proteins [37]. The supernatant was used for cellulase assays. Mycelia were collected for RNA extraction.

The activity of the produced cellulase was measured as described in another study [38]. In brief, the PNPCase and PNPGase activities were determined against 5 mM P-nitrophenol- d -cellobioside (PNPC, Sigma-Aldrich) and P-nitrophenyl β- d -glucopyranoside (PNPG, Sigma-Aldrich) as substrates in 50 mM sodium acetate buffer at pH 5.0 at 50 °C for 30 min, respectively. The release of P-nitrophenol was determined by measuring absorbance at 405 nm. One unit of PNPCase and PNPGase activities was defined as 1 μmol of P-nitrophenol released per minute. The CMCase activities were determined by incubation in 50 mM sodium acetate buffer with 1% carboxymethylcellulose (CMC, Sigma-Aldrich), at pH 5.0, 50 °C and for 30 min. The FPase activities were determined using Whatman filter paper as the substrate with a 50 mM sodium acetate buffer at pH 5.0, 50 °C, and for 30 min. One unit of CMCase or FPase activity was defined as the amount of enzyme producing 1 μmol of reducing sugar per min.

Cellulase production in a fermenter culture was conducted according to the method described by Li et al. [39] with some modification. In brief, fermentation was carried out in the 30-L fermenter (Shanghai Bailun Bio-technology Co., Ltd.) with an initial working volume of 10 L at 28 °C for mycelial growth. Seed cultivation was performed as follows: for each strain, about 10 9 conidia were inoculated into 1 L of 2× Mandels’ medium and 20 g/L of glucose, then cultivated by rotation (200 rpm) at 28 °C for 2 days. This culture was poured into 9 L of fresh 2× Mandels’ medium containing 10 g/L of wheat bran and 15 g/L of Avicel in a 30 L jar fermenter. A mixture of glucose and β-disaccharides (MGDS SUNSON ® , Beijing, China) was fed after inoculation. The feeding took place every 6 h, which maintained glucose concentration low, between 0.05 g/L and 0.30 g/L. The temperature was decreased to 25 °C after 48 h for more efficient cellulase production. The dissolved oxygen (DO) and pH were controlled as described by Li et al. [39]. The samples were taken every 24 h, and the supernatant was analyzed for the FPase, PNPCase, PNPGase, and CMCase activities. Mycelia were collected for biomass measurement.

RNA extraction and real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR)

The methods used for RNA extraction and RT-qPCR methods are as those described by Chen et al. [33]. In brief, total RNA was extracted from cell fresh weight using a FastRNA Pro Red Kit (MPbio, Irvine, CA, USA). Synthesis of cDNA from total RNA was performed using the TransScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix (TransGen, Shanghai, China), according to the manufacturer’s instructions. For RT-qPCR, the PerfectStart™ Green qPCR SuperMix (TransGen, Shanghai, China) was used (see Additional file 8: Table S1). The transcriptional levels of the sar1 gene and the RNA of the parental strain were measured for reference calculation and data normalization. Primers used in RT-qPCR are listed in Additional file 8: Table S2.

Pre-treatment and enzymatic hydrolysis of lignocellulose biomass

Dry dilute acid pretreated and bio-detoxified corn stover (containing 37.6% cellulose and 4.4% hemicellulose) was donated by Professor Jie Bao [40]. The hydrolysis efficiency of the crude cellulase was evaluated by mixing 5% (w/v) dry pretreated and bio-detoxified corn stover as a substrate and the same amount of crude enzyme (5 mL) in 50 mM phosphate buffer to a final volume of 20 mL at 50 °C and pH 5.0 for 72 h. The glucose concentration in the supernatant was determined using a glucose assay kit and glucose yield was analyzed as described by Li et al. [39]. In brief, the glucose concentration in the supernatant was measured with the GOD (glucose oxidase) method. The glucose yield was calculated as follows: Glucose yield (%) = (Glucose (g) × 0.9 × 100)/(Cellulose in substrate (g)).

Statistical analysis

All experiments were performed with at least three independent samples with identical or similar results. The error bars indicate standard deviation (SD) of the mean of triplicates. Student’s T test was used to compare two samples, and Duncan’s multiple-range test was used for multiple comparisons. Within each set of experiments, P < 0.05 was considered significant.


Videoyu izle: 2020 NEWS????